Bakteriyel genler ve hastalık şiddeti arasındaki bağlantıyı arayın

Escherichia koli (E.coli) bakteribu normal olarak bağırsak florası oluşum. Bununla birlikte, tek tek suşlar oraya ait değildir ve hastalığa neden olan özelliklere sahiptir. Ama bu nasıl? bağırsak mikrobu için patojenler?

E. coli bakterilerinin patojen olan ve hastalığa neden olmayan suşları vardır. Araştırmacılar şimdi bakterideki belirli genlerin neden olduğu hastalıkların şiddetiyle ilişkili olup olmadığını araştırdı. Sonuçları PLOS Genetics dergisinde yayınlandı.

Sistit ve sepsis nedenleri

TWINCORE - Deneysel ve Klinik Enfeksiyon Araştırmaları Merkezi'nin yakın tarihli bir yayınında açıklandığı gibi, Escherichia coli insan bağırsak florasının bir parçasıdır.

Sözde kommensal olarak, mikrop normalde orada herhangi bir hasara neden olmaz. Ancak bağırsakta ve diğer organlarda patojen, yani patojen olabilir. Örneğin ürogenital sistemde E. coli mesane enfeksiyonlarına neden olur ve kan dolaşımında sepsise (kan zehirlenmesine) neden olabilir.

Kan zehirlenmesi, bakteriyel enfeksiyonların korkunç bir sonucudur ve vakaların yüzde on ila 30'unda ölümcül olabilir. Böyle bir enfeksiyonun ciddiyeti, bağırsak mikropunun genetik yapısına dayanarak önceden tahmin edilemezdi.

Bazı genetik varyantlar

Hannover'deki TWINCORE'dan araştırmacılar, Paris Üniversitesi tıp fakültesinden meslektaşları ile birlikte, şimdi E. coli'nin belirli genetik varyantlarının daha şiddetli bir seyirle ilişkili olup olmadığını analiz ettiler.

RESIST araştırma grubu Systems Biology of Microbial Communities'in başkanı Marco Galardini, bunu yapmak için sözde genom çapında ilişkilendirme çalışması yürüttüler, diye açıklıyor.

Bilim adamı, "Bunu yapmak için iki büyük hasta çalışmasından bakteri örneklerini sıraladık ve bunları enfeksiyonun seyriyle ilişkilendirdik" diyor. Ayrıca yaş, cinsiyet veya önceden bilinen hastalıklar gibi özellikler de analize dahil edildi.

Hayatı tehdit eden hastalıklardan korunma stratejisi

Ekip, hastalığın şiddetini belirleyen genleri belirleyemedi. Ancak araştırmacılar başka bir ilginç keşifte bulundular: "Belirli bir gen kaseti, idrar yolunda başlayan enfeksiyonlarla açıkça ilişkiliydi" diye açıklıyor Galardini.

Uzmana göre bu, yaşamı tehdit eden hastalıklardan kaçınmak için bir strateji oluşturmak için kullanılabilir. Galardini, "Gelecekte, bir mesane enfeksiyonundaki patojenler sıralanabilir ve daha sonra ilaç tedavisinin önlem olarak ayarlanması gerekip gerekmediğine karar verilebilir" diyor.

Daha fazla sayıda numune gerekli

Araştırmacıların bakteri genomu ile hastalığın seyri arasında bir bağlantı kanıtlayamamış olması, mutlaka böyle bir bağlantı olmadığı anlamına gelmiyor.

Galardini'nin açıkladığı gibi, incelenen örneklerin sayısı çok az olabilir. "Bir simülasyon, bağlantıyı daha kesin bir şekilde tespit etmek veya ekarte etmek için örnek sayısının on katının gerekli olacağını gösterdi."

Bu nedenle, şimdi daha kapsamlı bir takip çalışması hazırlanmaktadır.